في إطار الاضطلاع بمهامها في دعم أجهزة المنظمة وتعزيز فاعلية أدائها المؤسسي، تركز أمانة المجلس التنفيذي والمؤتمر العام على مجموعة من الأولويات الاستراتيجية الرامية إلى تطوير أساليب العمل والارتقاء بجودة الأداء التنظيمي والتقني، وتعزيز حضور المنظمة وإشعاعها على المستويين العربي والدولي، وتيسير وصول منتجها المعرفي إلى أوسع نطاق من المستفيدين. كما تولي الأمانة أهمية خاصة لترسيخ مبادئ الحوكمة والتصرف الرشيد وثقافة التقويم، وتطوير الشراكات الاستراتيجية وأطر التعاون الدولي، إلى جانب تعزيز جاهزية المنظمة وقدرتها على الاستجابة الفعالة للأزمات والأوضاع الطارئة، بما يدعم استدامة عملها ويعزز قدرتها على تحقيق أهدافها ورسالتها.

وتتمثل أبرز هذه الأولويات الاستراتيجية في: